其余的那些还在顽抗的官兵们一看孙应元已经死了，再无一点斗志，于是立即都作鸟兽散，大批刑天军的兵将这才得以突破了定淮门，涌入到了城中，并且迅速的在刘耀本的指挥下，朝着城中四面八方的冲杀了过去。
也就是城门这短暂的一战，孙应元率军给攻入城中的刑天军造成了数百人的死伤，几乎将刑天军给阻止在了定淮门一带，可惜的是大部分官军斗志全失，没有跟着孙应元在这里死战到底，最终孙应元阵亡，定淮门也彻底失守，否则的话，他们甚至完全有可能，将定淮门再给堵上，使刑天军这一次耗尽力气的攻城以失败而告终。
眼看定淮门城头上竖起了一面刑天军的军旗的时候，城外大批刑天军兵将们都齐声欢呼了起来，士气顿时大为提振了许多，随即在肖天健的一声令下，纷纷朝着定淮门之中涌了进去。
本来城中官军数量就已经不多了，随着刑天军越来越多的人马涌入到定淮门之中，南京内城的战况也开始呈现出了一边倒的状态。
丁启睿在刑天军攻破定淮门之后，在诸将的保护下朝城中退却，丁启睿依旧不甘心失败，试图组织兵将反扑夺回定淮门，可是这个时候官军诸将也早就没了斗志，对丁启睿的命令大多都不肯执行，纷纷琢磨着自己的退路，只有少量的军将率部在城中和攻入城中的刑天军进行巷战，且战且退的退往城内。
而后续的刑天军一方面分兵朝城内攻进，一方面则派兵登上城墙，迅速的沿着城墙朝两侧进攻，去夺取更多的城门，一个个城门的守军这个时候也都开始得知南京城已破，顿时士气大衰，纷纷弃守了他们负责的城墙和城门，四处奔逃了起来，使得刑天军势如破竹一般的将几个城门夺占了下来，随即打开城门，放入了更多的刑天军兵将入城。
丁启睿在兵将的护送之下逃到了城西的秦淮河旁边，听着越来越多的地方开始响起喊杀声，越来越多的地方开始出现浓烟，于是便放声大哭了起来，跪地朝着北方连连叩头，自陈有罪，辜负了皇上对他的信任，最终也未能保住南京城，现如今他已经是走投无路，于是转身便要跳入秦淮河之中自尽，可惜他的手下还是将他拉住，裹着他继续朝着城南方向逃去。
一旦南京城这座坚城一处被攻破，城中守军的抵抗便如同多米诺骨牌一般开始垮掉，随着大批刑天军兵将的涌入，官军的抵抗开始显得越来越微弱了下去，待到一天之后，偌大的南京城的内城基本上便被刑天军控制在了手中。
而这一次攻打南京城之所以能够仅仅用了这么短的时间便获得成功，主要原因其实也就是几条，一是到了这个时候，官军之中的兵将们早已没有了誓死保卫南京城的斗志，纷纷投降了刑天军，二就是刑天军的士气很高，而且战斗力十分强悍，最重要的还是肖天健对于火炮的应用，他可以说是开创了这个时代集中使用炮兵的先河，将军中重炮集中使用，最终才轰开了定淮门这个缺口。
在后世那种信息大爆炸的时代，肖天健免不了会耳闻目染，知道许多关于军队的应用的事情，自然也就知道火炮这种战争之神的作用，在这个时代，他在刑天军之中，第一个创建了专职炮兵，并且集中使用炮兵来进行作战。
虽说那个红毛鬼子高肃熟悉操作火炮的方式，被后世之人誉做刑天军炮兵之父，但是实质上高肃的作用也仅限于为肖天健成批的培养了熟悉操作火炮的基础兵员，真正构架起炮兵这个专职兵种以及作战方式的还是肖天健。
南京城即便是再怎么坚固，也毕竟是死物，也不可能挡得住刑天军集中大批重炮，对一个地方进行猛轰。
再加上肖天健在刑天军早早的也组建起了专职的工兵部队，在这样的攻城战之中，工兵部队同样也发挥出了巨大的作用，他们利用了火炮压制住城上守军的机会，派出大批工兵对定淮门的瓮城实施了多次爆破作业，用大量的火药，最终炸塌了瓮城，暴露出了内部的城门，使得刑天军得以顺利的攻破定淮门。
所以这座在旁人眼中，几乎是不可能被攻破的城池，最终还是在肖天健的兵锋之下，被他的刑天军攻克，就此也开创了这个时代全新的攻城的方式，使得建筑城墙作为守御的时代，从此之后便逐渐的被终结，开创了一个新的时代。
整个南京内城的战斗进行了两天多的时间便基本上宣告结束了，肖天健在外城的临时帅府之中，不断的得到攻入城中各部的消息。
攻入城中的第二天清晨，有人送来消息，说在城中抓住了督师丁启睿，不久丁启睿便被五花大绑的送到了外城肖天健的临时帅府之中。
丁启睿现年不过四十五岁，可是当肖天健看到他的时候，却发现丁启睿已经是满头白发，身体也很是消瘦，看上去如同六七十岁的年纪一般，可见的这两年间，丁启睿为了对付他，可以说是耗尽了心力，不由得心中微微有些叹息。
对于丁启睿肖天健是知道他在原来历史上发挥的作用的，此人称不上是个能臣，但是却还是比较忠诚的，虽然被朝廷重用，但是也未能力挽狂澜于既倒，最终还是在南明被灭之后，投降了清军，后来又因为牵扯到反清复明的事情之中，被建奴所杀。
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