陈瀚回到天京长安城后对天京朝廷文武百官进行人事调整，赵明朗届满离任被调往东京任职，林江接任政务院相国一职，陈瀚又接连提拔了大批年轻文武入朝任职，满朝文武深感惊讶皇帝的人事安排，明显是对文官进行新一轮打压。
陈瀚下旨废除军务院战区建制，统一改设军区。对各军区驻军总经略进行人事调动，林阿凤调任海中军区总经略，陈懋功任平西军区总经略，董一元任华州军区总经略，黄阿旺任西州军区总经略，王士琦调任河中军区总经略。
陈瀚下旨升安西道为北京直隶，以大宛盆地（费尔干纳盆地）南部宛阳府为北京，修建北京行宫，在北京宛阳府设置六院加强统治，天汉帝国形成五京格局，北京、东京、南京的六院文武官员建制只有天京六院一半，由天京朝廷派出六院副级文武官员管理。
回到天京长安城数月后，陈瀚下旨对中原地区进行人口土地核查，法务院颁布中原地区土地法，中原地区百姓每户不得超过一千亩土地，否则视为土地兼并，将没收全部家产，全家流放。
天汉朝廷下令五京六院统一进行人口普查，登记户口、人口，陈瀚亲自下旨诸省道所有臣民必须取汉姓、汉名，加强汉化政策，避免西方严重重名下难以统计清楚究竟有多少人口。同时下旨在天下统一使用汉文、汉话，统一使用度量衡器具，统一使用朝廷制定的各种标准，大力推广融合中原方言为准的官话为通用语言。
天京中原辖区二十一省道人口普查最快，统计后共计有户两千三百六十五万三千八百余，有口一亿三千六百九十七万五千四百余，已经迁徙至海外西方诸省道三千余万人口没有包含在内，远远超出明朝官方《明实录》统计的七千余万人口。
东京辖区由于受西班牙殖民统治时期的天花传染以及残酷屠杀抓捕开矿损失的土著人口不下两千万，东京辖区人口普查统计为两千三百八十余万人口，其中包括从中原地区迁徙的六百余万人口。
西京辖区受战乱影响较重，加上14世界黑死病减少了一大半人口，包括大量迁徙的东方北方人口不下一千余万填充，普查统计为八千六百七十三万人口。
南京辖区也受战乱影响较重，加上从中原大量移民不下一千余万人口，普查统计为五千六百三十九万人口。北京辖区地广人稀，也遭受战乱叛乱影响严重，包括三百余万中原、黑水、安北、安东移民在内，普查统计为八百三十六万余人口。
天汉帝国治下人口大致在三亿以上，部落地区只能大致估算，附属国也没有准确数字，昆仑洲大陆更是无法统计。天汉朝廷对中原地区人口太过稠密，决定再次向四京辖区包括昆仑洲大陆大量移民五千万，解决中原地区历史困局，以后也将不断向海外西方大量移民，避免人口过多因天灾人祸造成动荡局面。
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