虽然赤木律子讲的好象很多，但总体来说就是那么些事——很久以前，某个外星天体携带着莉莉丝降临地球，与地球原本就存在的亚当发生接触，爆发了第一次冲击，碎片上升太空形成了月球，融合的两者诞生出生命之树与十八使徒，只不过因为生命之树本身孕育的果实的数量有限，最后只有早出生的那几位率先吃到了生命之果，最后的使徒（李林）只能吃剩下的智慧之果。
但既然叫做智慧之果，那么力量上自然和生命之果有所不同，所以最后的使徒李林因为力量不足的关系无法再维持住AT力场保有住现有的型体，分散成了‘群’，形成了星球上的霸主——人类。
而完成了孕育使命的生命之树也因为精华的耗尽，迅速枯萎，只留下一截残枝形成了拥有让所有使徒力量回归如初的朗基奴斯长枪。
然后消耗掉了一定力量的亚当和莉莉丝开始沉睡，任由新诞生的人类茫然的生活在那片蛮荒的世界上……直到1947年，一些吉普赛人偶然在约`旦溪谷的洞窟中发现了死海文书，这才算是解开自身的诞生之迷。但也在同时，让人类知道了一个可怕的事实，那就是当某个时间到来时，亚当所生的使徒会回归‘白之月’，莉莉丝所生的使徒会回归‘黑之月’，重新生长出生命之树并产生新形态的生命体。
这也是亚当为什么会被称为第一使徒，莉莉丝被称为第二使徒的原因。
而其中若亚当的使徒率先回归，将引发撞击，作为代价，另一方的后代将获得死亡！反之若是另一方回归莉莉丝，也会成为新生命形态。尽管最后的结果也是死，但灵魂将得到拯救。因此在这个约定时刻到来之前，人类要想顺利完成回归，就必须在此之前消灭全部的使徒。
这才是人类必须要和使徒战斗的根本原因，为了活下去！
只不过在这过程中，一群宗`教疯子却想要连最后一步也要进行下去，让全部的人类融合成一体，形成新的生命体——全灵，亦或者神，永恒的在宇宙中存活下去，用以来证明人类曾经存在过的痕迹，由此通过有着共同愿望的人建立了极机密组织SEELE，并制定出了所谓的‘人类补完计划’。
然而想要完好、顺利的实行‘人类补完计划’，那么作为第一使徒的亚当就必须要控制在自己的手里才行！所以为了这一目的，SEELE开始在全世界招收有才华的科学家。EVA计划的重要参与者及设计人之一的碇唯，明日香的母亲、冬月副司令便是这个时候加入SEELE的。
同理的还有葛城美里的父亲，赤木律子的母亲等，只不过所负责的项目并不相同罢了。
而其中葛城美里的父亲，理论推倒出了S2机关存在形式的葛城博士所负责的就是亚当的胚胎化回归的内容。当然，是被隐藏和阉割过的版本，也因此，他才会稀里糊涂的将自家的女儿带到南极，并因为不知情的原因傻傻的引发了第二次冲击，葬身南极。
反到是同样知道这一计划，且还知道的很详细的碇元渡率先带着资料跑路了，直到第二次冲击过后，才重新以救援人员的身份返回南极，救下了被葛城博士拼死救下的葛城美里。
而这之后，亚当因为释放完体内积累的全部力量回归成了胚胎，被碇元渡收回。莉莉丝的身体被炸成了碎块，也被碇元渡和SEELE的人带走，只剩下朗基奴斯枪因为某些原因被滞留在了南极深海当中。
与此同时，除了亚当、莉莉丝外的全部使徒正式开始苏醒。存有亚当灵魂的诸熏诞生，并被SEELE找到。初号机被制造完成，碇唯以牺牲自己的方式把灵魂融进了利用莉莉丝的肉`体复制出的初号机中，在想利用初号机的重要性阻止第三次冲击诞生的同时，作为EVA永生下去，向宇宙的其他文明或未来生物证明人类曾经存在过的痕迹。
同时也因此，碇元渡制定出了人类补完计划二号，为再见碇唯一次而努力中……
用亚当的血肉制造的其他号数的EVA被提上计划，开始制造。为此，明日香的母亲成了第二位牺牲者，被二号机吞噬了一半的灵魂，发疯。
利用莉莉丝的血肉精华混合碇唯残留的LCL物质中提取的信息代码的零波丽被制造成功，并通过早期的Dummy System系统将莉莉丝的灵魂转移到了零波丽的体内。
当然，这里的零波丽是复数的。毕竟使徒的灵魂何等强大？可不是区区一具普通人的身体就能承受的。至于现在嘛，则因为初号机的渐渐觉醒——暴走，以及零波丽本身的人格诞生而变得能够承受，这也是周朝为何敢就那么销毁中`央`教条区的灵魂之间中的克隆零波丽的主要原因。
再然后，就是使徒来袭，NERV迎战，基本大家都知道的事情了。
……
“这些……都是真的？”听完赤木律子那开诚布公的详细陈述，葛城美里脸上的表情即愤怒又悲伤，语气很是复杂的轻声追问道。
“是的，一切都是真的。”赤木律子语气平淡的确认道。
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